Wilde dieren opvangen is een grote verantwoordelijkheid. Het welzijn van het individuele dier staat altijd voorop en belangrijk hierbij is om in te schatten of een behandeling niet te belastend is en wat de meest geschikte vorm van hulpverlening zal zijn. Om een duidelijke lijn uit te zetten in het proces van eerste opvang tot uitzet werkt het opvangcentrum met een beleidstuk, opgesteld in samenwerking met het Dolfinarium in Harderwijk en Stichting Nationaal Onderzoek Dierentuinen dat is goedgekeurd door het ministerie van Landbouw, Natuurbeheer en Voedselkwaliteit (LNV).

Naast opvangwerkzaamheden wil SOS Dolfijn een educatieve rol vervullen door het publiek te informeren over dolfijnen en bruinvissen en vooral over het feit dat deze unieke dieren voor onze eigen Nederlandse kust voorkomen. Door educatie en voorlichting hoopt SOS Dolfijn zowel toekomstige als huidige generaties te inspireren mee te helpen aan de bescherming van de natuur. Door middel van zorg en onderzoek wil SOS Dolfijn ook een bijdrage leveren aan kennisvermeerdering over dieren waar nog relatief weinig van bekend is. Kennis over de natuur en de dieren die er in leven is essentieel om tot goed natuurbehoud te komen. Een bewustzijn van het belang van die natuur, en vooral van de rol daarin van de inheemse soorten, is hierbij van groot belang.

Daarom heeft Stichting SOS Dolfijn zichzelf als missie meegegeven:

Proactief en effectief bijdragen aan het behoud van inheemse dolfijnen en bruinvissen door middel van opvang, rehabilitatie, uitzet, educatie en onderzoek.